首先打开NCBI,在搜索框选择【Genome】,然后输入你要下载的物种拉丁名。如果NCBI还没有收录到该物种的基因组信息,比如我输入芥菜拉丁名Brassica juncea,搜索结果就如下面这样。

 bank文件
现在我们以拟南芥为例,下载拟南芥的基因组信息,输入拉丁名搜索结果如下:
点击“Genome Assembly and Annotation report”就进入下面的这个界面:
因为拟南芥基因组已经研究得比较透彻了,NCBI上也收录了不同版本的基因组信息,这个时候我们可以把scaffold contig前面的去掉,系统会自动为我们筛选比较好的基因组,一般来说我们选择level这一列中,测序水平最高的一组。就是黑部分占据面积最多的哈~(比如下面)
然后点击Assenbly这一列中的基因组组装编号,
终于进入全基因组下载界面:
(红框表示两个版本,上面的的版本是在下面版本的基础上更新的~)
我们下载最新的版本,点击TAIR10,终于进入下载界面了,在界面的右侧红框所示的地方即是下载链接~

 
注意哈,Genbank FTP site与Refseq.FTP.site都可以下载物种的全基因组信息,但是Genbank FTP site会提供RNA、蛋白的一个gff格式文件,而Refseq上没有(gff.是一个基因注释的文件,分析会用到),所以我们一般会下载Genbank FTP site的版本~
点击Genbank FTP site 后界面是下面这样的~(如果链接打不开,可能是浏览器的原因,建议用IE浏览器打开)
OK,现在可以下载你想要的基因组信息了~