核算中质量与浓度的换算
光度计测量的转换:
双链DNA (ds DNA)：A260 = OD260 = 1 相当于50 µg/ml溶液
单链DNA(ss DNA)：A260 = OD260 = 1相当于33 µg/ml溶液
RNA：A260 = OD260 = 1相当于40 µg/ml溶液
参考文献：Freifelder, D., Physical Biochemistry: Applications to Biochemistry & Molecular Biology, W.H. Freeman and Company, CA, 1982, p. 494-536.
核酸分子量计算方程式：
吸光度(A)＝摩尔消光系数×浓度×长度
500 bp的双链DNA＝325,000 Daltons
500 nt*的单链DNA＝162,500 Daltons *nt = nucleotide
dNMP的平均分子量＝325 Daltons（总的也就是腺苷三磷酸 dNMP，d是脱氧的意思,N是核苷总称(包括ATCG)，M代表1，P磷酸基团合起来就是脱氧核苷酸 2’-deoxynucleoside-5’-monophosphate）
寡聚体定量：寡聚体-寡聚体，是一种由数量较少的单体以共价键重复的连接而成的短多聚体，
双链DNA (ds DNA)：A260 = OD260 = 1 相当于50 µg/ml溶液
单链DNA(ss DNA)：A260 = OD260 = 1相当于33 µg/ml溶液
RNA：A260 = OD260 = 1相当于40 µg/ml溶液
参考文献：Freifelder, D., Physical Biochemistry: Applications to Biochemistry & Molecular Biology, W.H. Freeman and Company, CA, 1982, p. 494-536.
核酸分子量计算方程式：
吸光度(A)＝摩尔消光系数×浓度×长度
500 bp的双链DNA＝325,000 Daltons
500 nt*的单链DNA＝162,500 Daltons *nt = nucleotide
dNMP的平均分子量＝325 Daltons（总的也就是腺苷三磷酸 dNMP，d是脱氧的意思,N是核苷总称(包括ATCG)，M代表1，P磷酸基团合起来就是脱氧核苷酸 2’-deoxynucleoside-5’-monophosphate）
寡聚体定量：寡聚体-寡聚体，是一种由数量较少的单体以共价键重复的连接而成的短多聚体，
常是指氨基酸、糖、核苷酸的短多聚体。其单体的数目一般在20以下，常为2～10个37度
monomerie unit ( mer) ：单体单元，相当于nt或者BP都可以。通常用于双链核酸中的单位，100 mer DNA相当于每一条链有100nt，那么整条链就是100bp
20-mer，A260 = 1的贮存液含有5 nmol寡聚体：5 nmol = 33 µg/(20×325)
40-mer，A260 = 1的贮存液含有5 nmol寡聚体：2.5 nmol = 33 µg/(40×325)
pmol为单位的引物转换为µg为单位的引物：
（X pmoles×长度bp×325）/ 1,000,000
例：10pmoles的25-mer，则为
（10pmol×25bp×325）/ 1,000,000 = 0.081 µg primer
µg为单位的引物转换为pmol为单位的引物：
（X pmoles×1,000,000）/（长度bp ×325）
例：0.1µg的20-mer，则为
（0.1µg×1,000,000）/（20bp×325）= 15.4 pmoles primer
pcr扩增反应引物浓度的计算：
40-mer，A260 = 1的贮存液含有5 nmol寡聚体：2.5 nmol = 33 µg/(40×325)
pmol为单位的引物转换为µg为单位的引物：
（X pmoles×长度bp×325）/ 1,000,000
例：10pmoles的25-mer，则为
（10pmol×25bp×325）/ 1,000,000 = 0.081 µg primer
µg为单位的引物转换为pmol为单位的引物：
（X pmoles×1,000,000）/（长度bp ×325）
例：0.1µg的20-mer，则为
（0.1µg×1,000,000）/（20bp×325）= 15.4 pmoles primer
pcr扩增反应引物浓度的计算：
引物毫摩尔浓度（mM）= pmoles/µl
例1：100µl PCR反应体系中有20pmol的引物 = 0.20 mM
例2：引物为24bp，并溶解于0.1ml µl H2O中；
10µl溶液稀释至1.0ml测定其A260为：A260 = OD260 = 0.76；
则贮存液在260nm（A260）的吸光度为76；
0.1ml的贮存液含有7.6个单位的A260；
引物碱基组成为：A=6, C=6, G=6, T=6；
260nm引物的摩尔消光系数 = a(16,000) + b(12,000) + c(7,000) + d(9,600)
注：a、b、c、d分别是 A's、G's、C's、T's的碱基个数；
PCR引物的摩尔消光系数= 6(16,000) + 6(12,000) + 6(7,000) + 6(9,600) = 267,600
则PCR引物贮存液的摩尔浓度为：76/267,600 = 284 mM
例1：100µl PCR反应体系中有20pmol的引物 = 0.20 mM
例2：引物为24bp，并溶解于0.1ml µl H2O中；
10µl溶液稀释至1.0ml测定其A260为：A260 = OD260 = 0.76；
则贮存液在260nm（A260）的吸光度为76；
0.1ml的贮存液含有7.6个单位的A260；
引物碱基组成为：A=6, C=6, G=6, T=6；
260nm引物的摩尔消光系数 = a(16,000) + b(12,000) + c(7,000) + d(9,600)
注：a、b、c、d分别是 A's、G's、C's、T's的碱基个数；
PCR引物的摩尔消光系数= 6(16,000) + 6(12,000) + 6(7,000) + 6(9,600) = 267,600
则PCR引物贮存液的摩尔浓度为：76/267,600 = 284 mM
核酸数据
(Nucleic Acid Data)
(Nucleic Acid Data)
Kd是kilodaltons的缩写，既千道尔顿。是氨基酸的分子量单位。
Kbs是千碱基对的意思，是核酸的单位名称。
1个脱氧核糖核酸碱基的平均分子量为333 Daltons（道尔顿）
1个核糖核酸碱基的平均分子量为340 Daltons（道尔顿）
DNA与表达蛋白之间分子量换算：
1 kb DNA = 333 amino acid ≈3.7 × 104 Da（道尔顿）
10,000 Da Protein ≈ 270 bp DNA
30,000 Da Protein≈ 810 bp DNA
50,000 Da Protein ≈1350 bp DNA
100,000 Da Protein ≈ 27 kb DNA
1个脱氧核糖核酸碱基的平均分子量为333 Daltons（道尔顿）
1个核糖核酸碱基的平均分子量为340 Daltons（道尔顿）
DNA与表达蛋白之间分子量换算：
1 kb DNA = 333 amino acid ≈3.7 × 104 Da（道尔顿）
10,000 Da Protein ≈ 270 bp DNA
30,000 Da Protein≈ 810 bp DNA
50,000 Da Protein ≈1350 bp DNA
100,000 Da Protein ≈ 27 kb DNA
一个DNA碱基对（钠盐）的平均分子量 = 650 道尔顿
1.0 A260 unit ds DNA = 50 µg/ml = 0.15 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss DNA = 33 µg/ml = 0.10 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss RNA = 40 µg/ml = 0.11 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ds DNA = 50 µg/ml = 0.15 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss DNA = 33 µg/ml = 0.10 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss RNA = 40 µg/ml = 0.11 mM (in nucleotides)
双链DNA分子的分子量(道尔顿) = 碱基对数目×650
双链DNA分子的末端摩尔数 = 2 ×DNA质量（克）/ DNA分子量（道尔顿）
限制性内切酶酶切后的DNA末端摩尔数:
a) 环状DNA分子: 2 × DNA摩尔数× 位点数
b) 线性DNA分子: 2 × DNA摩尔数×位点数 + 2 × DNA摩尔数
双链DNA分子的末端摩尔数 = 2 ×DNA质量（克）/ DNA分子量（道尔顿）
限制性内切酶酶切后的DNA末端摩尔数:
a) 环状DNA分子: 2 × DNA摩尔数× 位点数
b) 线性DNA分子: 2 × DNA摩尔数×位点数 + 2 × DNA摩尔数
1 µg 1000 bp DNA = 1.52 pmol = 9.1 × 1011 molecules
1 µg pUC18/19 DNA (2686 bp) = 0.57 pmol = 3.4 × 1011 molecules
1 µg pBR322 DNA (4361 bp) = 0.35 pmol = 2.1 × 1011 molecules
1 µg M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 0.21 pmol = 1.3 × 1011 molecules
1 µg λDNA (48502 bp) = 0.03 pmol = 1.8 ×1010 molecules
1 µg pUC18/19 DNA (2686 bp) = 0.57 pmol = 3.4 × 1011 molecules
1 µg pBR322 DNA (4361 bp) = 0.35 pmol = 2.1 × 1011 molecules
1 µg M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 0.21 pmol = 1.3 × 1011 molecules
1 µg λDNA (48502 bp) = 0.03 pmol = 1.8 ×1010 molecules
1 pmol 1000 bp DNA = 0.66 µg
1 pmol pUC18/19 DNA (2686 bp) = 1.77 µg
1 pmol pBR322 DNA (4361 bp) = 2.88 µg
1 pmol M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 4.78 µg
1 pmol λDNA (48502 bp) = 32.01 µg
1 pmol pUC18/19 DNA (2686 bp) = 1.77 µg
1 pmol pBR322 DNA (4361 bp) = 2.88 µg
1 pmol M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 4.78 µg
1 pmol λDNA (48502 bp) = 32.01 µg
（学习的目的是增长知识，提高能力，相信一分耕耘一分收获，努力就一定可以获得应有的回报）
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