OR值的意义和计算公式，和95% CI
(2008-11-18 09:04:51)
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分类：统计遗传概念
杂谈
OR值的全称是odd ratio, 又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR 值即是相对危险度的精确估计值。
odds计算公式如下：
Odd ratio, 95% CI
假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）：记为Allele 1Allele 2
Allele 1Allele
2
病例A B
对照C D
OR值的全称是odds ratio、比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR值即是相对危险度的精确估计值。OR值的意义：
OR值等于1，表示该因素对疾病的发生不起作用；
OR值大于1，表示该因素是危险因素；
OR值小于1，表示该因素是保护因素。
计算公式如下：假定我们要鉴别因素（例如吸烟）是不是某个疾病的危险因素（例如肺癌）。形成如下四个表：
OR值= AD/BC。95%的置信区间就不用公式了，下面用SPSS实现。
SPSS不支持4格表，需要原始的阴性和阳性的数据，即，形式如下（一般情况下，1-是，0-否）。
使用卡方检验，计算P值，同时可以计算OR值。SPSS里计算OR值的具体方法：
菜单Analyze – Descriptive Statistics – Crosstabs，在弹出的Crosstabs里，Row
和Column的框里分别添加吸烟和肺癌两个变量（行列可以相互交换，不影响OR的计算结果）。点击Statistics按钮，弹出对话框，勾选Chi-square和Risk，然后Continue。其他不用管，按下OK按钮进行运算。结果里产生了3个表格：
第1个是数据是否确实等情况和4格表。
第2个可以看到第1行卡方值和检验的P值。根据注释b，看有几个cell（四格表的格子）的预测值小于5，如果有1个（25%）及以上的cell的预测值小于5，则需要看Fisher’s Exact Test一栏的P值，否则就是第1行的卡方检验P值就可以了。
第3个表格的第1行就是OR值了，可以看到OR值和95%CI。
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