作者: 张婷婷[1];庞雪原[1];晏佳芸[1]
作者机构: [1]东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150036
出版物刊名: 科技资讯
页码: 22-22页perl语言学习
年卷期: 2019年 第13期
主题词: GC含量;生命科学;Perl语言编程;字符串拆分;正则表达式
摘要:生命科学领域中无论是PCR还是测序,都需要了解目的核酸的GC含量。由于目前缺乏独立统计核酸GC含量的程序。该文采用Perl语言编程,设计处理了核酸序列统计GC含量的程序。程序采用了BioPerl环境,利用字符串拆分、遍历算法和正则表达式对核酸序列进行GC碱基的挖掘。最后该脚本可以应用于Windows和Linux系统。适合用于多环境。