SNP array 技术用于先天性心脏病胎儿产前诊断的研究(全文)1.SNP array检测在CHD胎儿产前诊断中的意义:
常规染体核型分析是染体异常诊断的“金标准”方法。染体核型分析对整倍体异常及大片段结构异常的检出率较高,检测费用低,目前仍是胎儿染体异常的重要检查手段。但同时,染体核型分析有着不可避免的技术弊端,例如,染体核型分析不能检测<5 Mb的染体微缺失或微重复,而这些微缺失或微重复与一些疾病密切相关,这限制了染体核型分析在一些致病性染体异常上的应用。SNP array检测可以对样本进行全基因组高分辨率扫描,提高了致病性CNV的检出率,目前已广泛应用于智力低下、自闭症、原因不明的发育迟缓、多发畸形等疾病的临床检测。为了进一步了解CHD的病因,研究者结合了心脏的发育机制、流行病学、病因学,提出了多个层次、多个角度的CHD分类方法[13]。
2.SNP array检测在CHD产前诊断中的检出情况:
本研究中,同时将传统染体核型分析及SNP array检测应用于679例经超声检查诊断为CHD胎儿的产前诊断,发现CHD胎儿的染体异常的总检出率为19.5%(132/677),与Yan等[14]的报道基本一致。这些染体异常除了整倍体异常(如21三体、18三体等)和结构性异常(染体多态性)外,基因组CNV也是导致CHD的主要原因之一。SNP array 检测在染体微重复和(或)微缺失CNV的检测上优于染体核
型分析(P<0.05),而在多态性检测上存在局限性。本研究中,致病性CNV的总检出率为3.5%(24/677),与之前报道的数据[15]基本相符。
Shaffer等[16]通过对2 858例超声检查发现结构异常的胎儿的SNP array检测结果进行回顾性分析发现,在不同器官结构异常的胎儿中,SNP array检测的检出率不同,其中,以室间隔缺损和左室发育不良为代表的CHD胎儿的染体异常的检出率分别达10.6%和16.2%。Mademont -Soler等[17]对276例心脏超声检查异常的胎儿进行遗传学检测发现,这些胎儿中除了染体核型分析检测出的44例染体异常及8 例22q11微缺失综合征外,SNP array检测还另外检出了2%的染体异常。CHD 的类型多样,不同类型的CHD遗传学背景不同;因此,对不同类型的CHD 胎儿进行检测时,SNP array检测的异常检出情况可能会有不同,SNP array检测和染体核型分析的获益情况也会不同。染体多态性
研究表明,在约30%的CHD 儿童中发现染体异常[18];如唐氏综合征、Williams 综合征、Noonan 综合征、Charge综合征、22q11微缺失综合征等,都与胎儿CHD和发育迟缓相关[19Chat综合征)。
3.SNP array检测在临床应用中的问题:
SNP array检测在临床应用中所面临的最大的困难是,临床医师如何对VOUS 的CNV 进行遗传咨询。在本研究中,SNP array 在677 例样本中检测出31 例VOUS 的CNV,检出率为4.6%。Yan等[14]的研究表明,VOUS的检出率为5.3%(4/76)。目前在临床上还不能确定这些VOUS变异与表型之间的相关
性或者证据不足;当检测结果显示为VOUS时,即使无法解释,但仍有可能是致病的原因。从这个角度,排除家族性良性突变,并给予孕妇及家属合理的遗传咨询是非常必要的。
随着最近对母亲血液中胎儿DNA的关注,改进的分子技术可应用于与CHD相关的无创产前诊断,为临床应用前景增加了价值;这些优势使学者对改进的分子技术包括SNParray检测在胎儿染体异常的无创产前检测的潜力充满期待。使用从母亲血液中分离的胎儿DNA进行更大样本量和SNP array检测的进一步研究,将提供更多的证据。
SNP array检测等CMA技术可检出染体的数目异常和微小片段的CNV。本研究的结果显示,SNP array检测应用于临床不平衡染体病的诊断和产前诊断,可快速、准确地在分子水平上做出明确诊断。在CHD 胎儿的产前诊断方面,SNP array检测比传统的染体核型分析对CNV 的检出率更高。因此,SNP array 检测能提高CHD胎儿的检出率,在CHD 胎儿的产前诊断中具有较大的临床应用价值。